微生物在提高和实现池塘的生产力中起到主要的作用，没有微生物的存在，池塘的生产力是无法实现的。
在传统的养殖方法中，微生物依然是池塘生产力的主要体现者之一。土池底部的有机物和水体的有机物，是池塘第一生产力，其生产力的体现是通过微生物参加氮循环来实现的。
从上图我们可以看到，传统的水产，生产力的体现通俗说就是、就是把池塘底泥、水体中的氮变成鱼虾肉。这个转化为鱼虾肉的过程，池塘的微生物起到重要的作用，没有微生物的分解，很难实现这一步。
但是我们一定要意识到；微生物在水体的物质循环中的作用是有极限的，我们人为的添加微生物也只能够强化了这些转化能力但不能无限度的增加这些转化能力。同时池塘天然的生产力是会受池塘理化条件、气候的影响。
二、影响微生物提高池塘生产力的因素
1、池塘的物理因素、这里包括气候因素（温度、光照）和水体的深度等等因素。
A 太阳辐射决定了水体光合作用放氧量和呼吸作用耗氧量，水体的溶解氧浓度是微生物能够进行有氧分解代谢的物质基础，有充足的溶解氧，水体氮循环就可以良性进行，从而实现了生产力。
B 水温、决定了微生物状态，太低的水温，微生物很难进行代谢。
C 水体深度、光照强度随水深的增加而迅速递减，水中浮游植物的光合作用及其产氧量也随之减弱，至某一深度，浮游植物的光合作用产生的氧量恰好等于浮游生物呼吸作用的消耗量，此深度(m)即为补偿深度，此点的辐照度为补偿点（单位μE）。补偿深度以上的水层称为增氧层，以下的水层称为耗氧层。在人工增氧条件不足的池塘，太高的水位也带来了一定的负面影响。
2、生物因素
藻类就是池塘中的生产者，这些浮游藻类的种类和数量也决定了池塘的生产力。
A 以鞭毛藻和以甲藻为优势种的水体，是一种不利于养殖的种群。
B 藻若繁殖过剩，发生藻败，引起水质和底质变坏，造成对虾发病和死亡。 池塘中浮游植物的数量和繁殖速率是决定池塘产量的一个重要条件。
3、池塘化学因素
A 盐度
这个主要是决定养殖水的渗透压及养殖品种对渗透压的调节能力，这里不提。
B pH与二氧化碳平衡体系
水中CO2—HCO3-—CO32-及Ca2+—CaCO3是两个重要的缓冲系统，对养殖水的pH值的具体数值与稳定性有决定性的影响。这里也不提
C 溶解气体、
池塘中溶解氧的消耗主要是水中浮游生物、细菌和水中有机物氧化分解，亦称“水呼吸”，一般可占水中溶解氧总支出的70%左右；池底淤泥中有机物分解也要消耗大量的氧气，而养殖对象消耗氧气的比率很低。 足够的溶解氧是维持浮游生物、细菌和水中有机物氧化分解的必要条件，也就是我们能不能有活菌的必须条件。
D 营养盐
浮游植物生长繁殖所需从环境中索取的物质统称为营养盐类，包括氮、磷、钾、钠、硅、钙、铁、碳及微量的锰、锌、铜、钴、锌、镁、钼等。其中氮、磷的含量是决定池塘生产力高低的一个重要条件。
这一条也不提了。
随着我们的养殖产量的提高，随着我们外来水源的污染严重、底泥的有机物的不断积累，微生物对底改的作用就只能被置于次要的位置了甚至有时候一定要把微生物的活动（也就是我们说的生物底改）停下来才能保证我们的水质。把微生物的活动（也就是我们说的生物底改）停下来具体做法就是、消毒！
三、微生物代谢需要的条件
微生物的代谢需要的条件也就是能够使用活菌的条件，在没有微生物代谢需要的条件下使用活菌，可能是秃子抢梳子—多余，也可能是蛀虫咬黄连---自讨苦吃。所以当朋友们有:今天手痒痒了，咱们去泼菌！这个念头的时候。咱们应该先看看、大爷的水质、当时的气候能不能满足、活菌代谢需要的条件！
1、水体的耗氧量必须能够满足微生物代谢的需要（也就是底泥、水体会不会太肥，当然只是适当的肥，那么活菌会很好的提高池塘的生产力）
上面在这种池塘条件的水体，如果你还习惯性的定期使用活菌，可能真的是、买咸鱼放生---净做糊涂事。
2、水温必须满足微生物代谢的需要
使用活菌的时候，你就要看看、气候、水温是否在极端高温或者低温？
前年在说冬棚养殖的关键点时已经提过、太低的水温慎用活菌，避免低温时微生物不代谢，回温时微生物太多的现象。
3、当天是否有阳光
阳光是构成微生物有氧分解有机物，藻通过光合作用在吐出氧气供给微生物代谢需要的溶解氧同时、藻摄取小分子氮合成自身的蛋白质。完成了池塘生产力的第一步。在没有阳光的条件下，微生物的分解产物消耗就成了一个问题。
所以，在阴天或者阳光比较差的室内养殖，微生物的使用，您悠着点！前几天咱们一个室内养殖的朋友池塘亚硝酸盐和氨氮高了，提出、使用分解芽孢好不好？回答是、不好，这个做法是完全违背了水体净化养殖！这样子只能够氨氮、亚硝酸盐更加高！
当然、光合细菌等等EM也可以摄取水体的氮合成自身的蛋白质，所以、这里你可以提出、咱们采取絮团养殖，不需要藻啦！咱们把氮完全的自我消化，对！有条件做到这一点你当然可以这么做！
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微生物直接或间接地作用于水产养殖对象和养殖环境，很好地分解养殖生物排泄物、残饵以及浮游植物残体等有机物，同时微生物链在水质净化中通过氧化、还原、光合、同化和异化作用把有机物转变为简单的化合物，保证水质的正常功能，从而维持养殖环境生态系统中养殖生物、病原、水质间的平衡。
微生物参与碳循环的转化，主要是通过它们对各种含碳化合物，特别是含碳无氮有机物的作用而进行，其主要是常见的发酵和氧化作用。
水环境表层有氧区氧化作用，底层无氧区无氧发酵作用使含碳物质转化为二氧化碳供植物光合作用利用。
养殖水体中的氮能促进或限制水产养殖生态系统中物质能量的转化，也是浮游植物生长限制性营养元素之一。
含氮有机物经微生物分解而产氨的过程。氨化微生物很多，包括细菌、放线菌和真菌等。
即氨经过亚硝酸的中间阶段而氧化为硝酸的过程。包括硝化细菌等。
即使游离分子氮活化而形成氮化物的作用。养殖水体中的某些微生物具有一些特殊的酶系统，能把一般生物不能利用的氮转化为生物能利用的化合物形式，许多放线菌、真菌和藻类具有这种功能。
磷作为浮游植物生长的限制性营养元素，其对水体初级生产力的限制作用往往比氮更强。
磷以3种形式存在于养殖环境中：溶解无机磷、溶解有机磷和颗粒磷。3种形式的转化在微生物的作用下构成磷的一个重要的复杂动态循环。
硫以3种形式存在于养殖环境中：氧化态-II（硫化物、硫化氢等），氧化态，氧化态+硫酸盐。许多微生物可用硫酸盐作为硫的唯一来源，以氧化态把它转变成为有机的硫氢基化合物。
碳循环中微生物分解有机物释放二氧化碳，经植物的光合作用合成复杂的有机物，为底栖动物、鱼虾蟹类提供和多糖类物质；
氮循环中微生物通过氨化作用、硝化作用、反硝化作用和固氮作用把含氮物质变为有机氮，为水产养殖提供饵料和肥料等蛋白质物质，生成硝酸盐为藻类所利用，从而降低水体中的氨气、氨氮与亚硝酸氮，起到了净化作用；
磷循环中微生物使水中的溶解态的磷被悬浮颗粒吸咐形成颗粒态磷，经凝絮作用转为沉淀，有效地降低了水体的磷元素，同时也为动物提供了其需要的磷元素；
硫循环中在微生物的作用下产生硫酸盐和硫化氢等，其中硫化氢对许多需氧微生物有毒作用，同时硫化氢与金属生成沉淀，降低了有害的硫化氢，硫酸盐可为动物提供需要的含硫氨基酸等。
因此，微生物在碳、氮、磷、硫循环中都起了非常重要的作用，它可以促进四大元素在生态链中转化，保持了水产养殖环境的动态平衡，从而抑制有害生物，形成有益微生物菌群，分解有机物，消除有害物质（NH3、H2S、过量的N、P等），有效地净化了水质，减少水产养殖动物疾病的发生，提高其成活率，促进养殖动物的生长。
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